Grundlage der Behandlung in der Klinik Lilienthal ist eine moderne Diagnostik. Sie erfolgt weitestgehend mithilfe nicht- oder nur gering belastender Untersuchungsmethoden, z.B. mit einer endoskopischen Einheit mit modernen Endoskopen zur Untersuchung des oberen und unteren Verdauungstrakts. Die Untersuchungen werden schmerzfrei unter leichter Sedierung und unter Monitorüberwachung durchgeführt. Zur nicht-invasiven Diagnostik stehen darüber hinaus zwei moderne Sonografiegeräte mit Farbdoppler zur Verfügung.